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IDH1

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IDH1 - Pesquisa PCR do gene IDH1

Sinônimos: IDH1 (isocitrato desidrogenase 1)

Identificação de mutação somática no gene IDH1 em vários tipos tumorais.

Prazo:

5 dias úteis após recebimento da amostra

Material / Meio de coleta:

Tecido tumoral / Bloco de parafina

Técnica:

PCR / RT-PCR / qPCR / Eletroforese Capilar

Topografia:

Cabeça e pescoço, Partes moles, Sangue e medula óssea, Sistema nervoso central, Tecido ósseo

Aplicação Clínica:

Diagnóstico, Prognóstico

Indicação para o teste:

  • O status mutacional de IDH1 é um marcador prognóstico em indivíduos com gliomas de baixo e alto grau. Ajuda a distinguir um glioblastoma primário de um secundário.
  • Apoio no diagnóstico diferencial de tumores ósseos condroides.
  • Estratificação prognóstica na leucemia mielóide aguda.


Procedimento e interpretação do teste:

  • Tipo de amostra: tecido tumoral.
  • Preparação da amostra: Fixação de formalina (formalina tamponada neutra a 10%) e tecido embebido em parafina. Proteger do calor excessivo. O bloco de tecido será devolvido após o teste. Bloco de tecido ou 4 lâminas de 5 mícrons não coradas. (Mínimo: 3 slides).
  • Extração de DNA, avaliação qualitativa e quantitativa.
  • Metodologia: Identificação das mutações R132 em vários tipos tumorais.
  • Limitações: O limite de detecção para este teste é de 20 por cento do alelo mutante. Resultados deste teste deve sempre ser interpretado dentro do contexto clínico e com outros dados relevantes, e não deve ser usado sozinho para um diagnóstico de malignidade. Este teste não se destina a detectar doença residual mínima.


Relevância clínica:

Mutações no exon 4 do gene IDH1 em "hotspots" R132 de IDH1 estão frequentemente presentes em gliomas e em um subconjunto de casos de leucemia mieloide aguda. Mutações IDH1 nos gliomas estão geralmente associadas a um melhor prognóstico. No contexto da leucemia mieloide aguda, o significado prognóstico de IDH1 mutações é dependente do contexto.

Variantes do gene IDH1 também podem auxiliar no diagnóstico diferencial de tumores ósseos condroides e fornecer informações prognósticas relevantes em outros contextos, como no cenário de leucemia mieloide aguda (LMA).

Este teste não pode diferenciar entre alterações somáticas e germinativas. Testes adicionais podem ser necessários para esclarecer o significado dos resultados se houver um risco hereditário potencial.


Resultados e considerações:

  • Negativo: Mutações pontuais e pequenas mutações de inserção/deleção nas regiões alvo do gene IDH1 não detectadas. Um resultado negativo não exclui a presença de uma variante que pode estar presente, mas abaixo dos limites de detecção deste ensaio.
  • Positivo: Mutações pontuais e pequenas mutações de inserção/deleção nas regiões alvo do gene IDH1 detectadas.

Este teste não detecta variantes estruturais, alterações no número de cópias genômicas ou grandes deleções ou duplicações de um ou vários exons no gene IDH1.

Polimorfismos raros podem estar presentes que podem levar a resultados falso-negativos ou falso-positivos.

Os resultados dos testes devem ser interpretados no contexto dos achados clínicos, amostragem do tumor e outros dados laboratoriais.


Referências:

  1. Horbinski C, Kofler J, Kelly LM, et al: Diagnostic use of IDH1/2 mutation analysis in routine clinical testing of formalin-fixed, paraffin-embedded glioma tissues. J Neuropathol Exp Neurol. 2009 Dec;68(12):1319-25. doi: 10.1097/NEN.0b013e3181c391be. PMID: 19915484.
  2. Parsons DW, Jones S, Zhang X, et al: An integrated genomic analysis of human glioblastoma multiforme. Science. 2008 Sep 26;321(5897):1807-1812.
  3. Yan H, Parsons DW, Jin G, et al: IDH1 and IDH2 mutations in gliomas. N Engl J Med. 2009 Feb 19;360(8):765-773.
  4. Hartmann C, Meyer J, Balss J, et al: Type and frequency of IDH1 and IDH2 mutations are related to astrocytic and oligodendroglial differentiation and age: a study of 1,010 diffuse gliomas. Acta Neuropathol. 2009 Oct;118(4):469-474.
  5. Brat DJ, Verhaak RG, et al: Comprehensive, Integrative Genomic Analysis of Diffuse Lower-Grade Gliomas. Cancer Genome Atlas Research Network, N Engl J Med. 2015 Jun 25;372(26):2481-2498
  6. Eckel-Passow JE, Lachance DH, Molinaro AM, et al: Glioma Groups Based on 1p/19q, IDH, and TERT Promoter Mutations in Tumors. N Engl J Med. 2015 Jun 25;372(26):2499-2508.
  7. Chotirat S, Thongnoppakhun W, Wanachiwanawin W, Auewarakul CU: Acquired somatic mutations of isocitrate dehydrogenases 1 and 2 (IDH1 and IDH2) in preleukemic disorders. Blood Cells Mol Dis. 2015 Mar;54(3):286-291.

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